まめトーーク!

バイオマーカー開発やパスウェイ解析のための統計解析・インフォマティクス技術に関するメモ。

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2010-07-07

転写因子データベース

転写因子に関する情報がキュレーターにより詳細にまとめられている。APIも公開されており、プログラムから利用するのに便利。ここから。
2009-05-29

遺伝子名称シソーラス

様々な表記で表される遺伝子名称が整理されています。SwissProt IDとEntrez Gene IDも付加されています。しかし、なじみ深い遺伝子名はOfficial Gene Symbolじゃなかったりするのですよね...。統合データベースプロジェクトでサービスしています(II-1.1 遺伝子名称シソーラス)。

2009-04-14

密売東京

名前は怪しいがヤバいものを売っているわけではない。

密売東京。

2009-04-14

シェルループ:いまさらTips備忘録

seq コマンドで連番を生成できる。

1から2000までの連番。

seq 1 2000

刻み幅も指定可。

seq 10 5 100

など...。

ループにつかえる。

for n in `seq 1 10000`
do
   hoge
done

2009-03-12

Network Garally

生物に限らず、様々な事象がネットワークで表現される。自然界/社会に存在するネットワークはとても印象的です。visual complexityはそんなネットワークが集められているサイトです。
脳の神経回路網のモデル。

Neural Network

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