まめトーーク！

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様々な表記で表される遺伝子名称が整理されています。SwissProt IDとEntrez Gene IDも付加されています。しかし、なじみ深い遺伝子名はOfficial Gene Symbolじゃなかったりするのですよね...。統合データベースプロジェクトでサービスしています（II-1.1 遺伝子名称シソーラス）。

名前は怪しいがヤバいものを売っているわけではない。

密売東京。

seq コマンドで連番を生成できる。

1から2000までの連番。

seq 1 2000

刻み幅も指定可。

seq 10 5 100

など．．．。

ループにつかえる。

for n in `seq 1 10000`
do
　　　hoge
done

生物に限らず、様々な事象がネットワークで表現される。自然界／社会に存在するネットワークはとても印象的です。visual complexityはそんなネットワークが集められているサイトです。
脳の神経回路網のモデル。

バイオロジでは様々なデータを扱います。遺伝子／タンパク質、それらの配列、プローブ、立体構造．．．。各々はデータベース化され、特有のIDで管理されています。ひとつのテーマに対して、多角的に解析を行う場合、各種情報を統合的に扱う必要があり、IDの相互変換は避けては通れません。ただ、概念的には繋がる情報もexactに1対1で扱えるわけではありません。解析時は複数のテーブルをスクリプトでつなげていくわけですが、こういった作業のためのベースとなるデータベースが存在します。よく使うものをいくつか．．．。

スペイン製：
Clone/Gene ID Converter

これはcitationできます。
Alibés A, Yankilevich P, Cañada A, Díaz-Uriarte R.
IDconverter and IDClight: conversion and annotation of gene and protein IDs.
BMC Bioinformatics. 2007 Jan 10;8:9.　PMID: 17214880

日本製：
ID一括変換システム

便利です。ありがたや。